ФГБУ "Краснодарская МВЛ" осуществляет постоянный контроль системы менеджмента качества в структурных подразделениях, посредством проведения внутренних аудитов. 26 октября 2016 года согласно утвержденной "Программы проведения внутреннего аудита в ИЦ "ФитоСемЭксперт" на 2016 год аудиторской группой в составе специалиста по качеству Дарьи Щетининой , начальника отдела инспекции по фитосанитарному направлению - технического Руководителя Ирины Слюсаренко , начальника отдела карантина растений Александр Осипова а и главного агронома отдела карантина растений Сергея Моисеенко проведен внутренний аудит Новокубанского межрайонного отдела.
В ходе аудита проведена оценка системы менеджмента качества (СМК) на соответствие требованиям ГОСТ ИСО/МЭК 17025-2009 «Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий». В ходе проверки аудиторы получили достоверную и объективную информацию о результативности СМК в отделе.
По итогам внутреннего аудита оформлены «Отчеты о несоответствиях» с указанием корректирующих действий, анализа причин, ответственных сотрудников за устранение несоответствий и сроков их выполнения, а также «Сводный отчет», содержащий заключения и выводы по результатам аудита.